reducers: add KernelPCA, Isomap, MDS, SpectralEmbedding, GaussianRandomProjection
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958fa019ea
@ -210,6 +210,67 @@ REDUCERS: Dict[str, Dict[str, Any]] = {
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("rotation", "str", "", ["", "varimax", "quartimax"], "Empty = None."),
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("rotation", "str", "", ["", "varimax", "quartimax"], "Empty = None."),
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],
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],
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},
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},
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"sklearn.decomposition.KernelPCA": {
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"pkg": "sklearn",
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"label": "KernelPCA",
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"blurb": "Non-linear PCA via the kernel trick. Deterministic; kernel choice shapes the output.",
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"key": [
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("n_components", "int", 2, None, "Locked."),
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("kernel", "str", "rbf", ["linear", "poly", "rbf", "sigmoid", "cosine"], None),
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("random_state", "int", 42, None, None),
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],
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"advanced": [
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("gamma", "str_or_float", "", None, "Empty = 1/n_features."),
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("degree", "int", 3, None, None),
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("coef0", "float", 1.0, None, None),
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("alpha", "float", 1.0, None, None),
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],
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},
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"sklearn.manifold.Isomap": {
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"pkg": "sklearn",
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"label": "Isomap",
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"blurb": "Geodesic-distance manifold learning via shortest paths on a k-NN graph.",
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"key": [
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("n_components", "int", 2, None, "Locked."),
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("n_neighbors", "int", 5, None, None),
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],
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"advanced": [
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("metric", "str", "minkowski", None, None),
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("p", "int", 2, None, "Minkowski power (1 = manhattan, 2 = euclidean)."),
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("path_method", "str", "auto", ["auto", "FW", "D"], "Floyd-Warshall / Dijkstra / auto."),
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("neighbors_algorithm", "str", "auto", ["auto", "ball_tree", "kd_tree", "brute"], None),
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],
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},
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"sklearn.manifold.MDS": {
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"pkg": "sklearn",
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"label": "MDS",
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"blurb": "Multidimensional scaling. Preserves pairwise distances; O(n²) memory.",
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"key": [
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("n_components", "int", 2, None, "Locked."),
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("n_init", "int", 4, None, None),
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("random_state", "int", 42, None, None),
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],
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"advanced": [
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("max_iter", "int", 300, None, None),
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("metric_mds", "bool", True, None, "Metric (True) vs non-metric MDS."),
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("metric", "str", "euclidean", None, None),
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("eps", "float", 1e-6, None, "Convergence tolerance."),
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],
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},
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"sklearn.manifold.SpectralEmbedding": {
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"pkg": "sklearn",
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"label": "SpectralEmbedding",
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"blurb": "Laplacian eigenmaps on an affinity graph. What UMAP uses for initialisation.",
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"key": [
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("n_components", "int", 2, None, "Locked."),
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("affinity", "str", "nearest_neighbors", ["nearest_neighbors", "rbf"], None),
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("random_state", "int", 42, None, None),
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],
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"advanced": [
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("n_neighbors", "int_or_null", "", None, "For affinity=nearest_neighbors. Empty = n/10."),
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("gamma", "str_or_float", "", None, "For affinity=rbf. Empty = 1/n_features."),
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],
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},
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"sklearn.manifold.TSNE": {
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"sklearn.manifold.TSNE": {
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"pkg": "sklearn",
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"pkg": "sklearn",
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"label": "t-SNE",
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"label": "t-SNE",
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@ -295,6 +356,16 @@ REDUCERS: Dict[str, Dict[str, Any]] = {
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("weight_adj", "float", 500.0, None, None),
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("weight_adj", "float", 500.0, None, None),
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],
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],
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},
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},
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"sklearn.random_projection.GaussianRandomProjection": {
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"pkg": "sklearn",
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"label": "GaussianRandomProjection",
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"blurb": "Johnson-Lindenstrauss baseline. Cheap, distance-preserving in expectation, structure-agnostic.",
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"key": [
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("n_components", "int", 2, None, "Locked."),
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("random_state", "int", 42, None, None),
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],
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"advanced": [],
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},
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}
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}
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